سامانه جامع معاونت فرهنگی اجتماعی | کارگاه آموزشی و کاربردی نرم افزار جینیوس و کاربرد آن در آنالیزهای بیوانفورماتیکی

انجمن علمی دانشجویی بيوتكنولوژي

کارگاه آموزشی و کاربردی نرم افزار جینیوس و کاربرد آن در آنالیزهای بیوانفورماتیکی

مهسا نصيري

نوع درخواست:	کارگاه و کلاس آموزشی (کارگاه (ورکشاپ) علمی و آموزشی )
سطح برگزاری:	کشوری
تاریخ برگزاری:	چهارشنبه, 15 اردیبهشت 1400
مکان برگزاری:	آنلاین
مجموعه‌های همکار:	انجمن علمی دانشجویی بیوتکنولوژی دانشگاه شیراز با همکاری اتحادیه ها و سایر انجمن های علمی علوم‌زیستی
مدت زمان برنامه(دقیقه):	120
تعداد افراد شرکت کننده:	25

انجمن علمی دانشجویی بیوتکنولوژی دانشگاه الزهرا (س) با همکاری انجمن علمی بیوتکنولوژی دانشگاه شیراز و با مشارکت اتحادیه‌ها و سایر انجمن‌های علمی علوم زیستی، "کارگاه آموزشی و کاربردی نرم افزار جینیوس و کاربرد آن در آنالیزهای بیوانفورماتیکی"‍ را با هدف توسعه مهارت‌های دانشجویان در بیوانفورماتیک و با تدریس ابوذر قربانی در روز چهارشنبه، 15 اردیبهشت 1400، از ساعت 17 الی 19 در فضای اسکای روم برگزار کرد. همانطور که توالی ژنی مهره داران رو به تکمیل بوده و تحقیقات به سمت آنالیز آنها می رود، نمایش دادن توالی ها به شکل ملموس بسیار حیاتی می باشد، چرا که نمی توان ۳ میلیارد ژن را نمی توان پشت سر هم در یک صفحه نمایش دادا بعنوان یک جایگزین، سایت UCSC Genorme Browser یک از هر بخشی از ژن که مورد نظر کاربر است را در هر مقیاسی که باشد به شکل سریع و مفهوم همراه با ۱۰ ها اطلاعات های جانبی مربوط به ژن نمایش می دهد. این اطلاعات می تواند شامل: ژن های شناخته شده، ژن های پیش بینی شده، ESTها، mRNAها، جزایرCpG ، باند های کروموزومی، همولوگ های موشـی آن و باشـد. نیمی از اطلاعات جانبی که توسط UCSC آماده شده و به نمایش گذاشته می شوند، از توالی های موجود با دسترسی عمومی به دست آمده اند. اطلاعات باقی مانده توسط محققان سراسر جهان حاصل گردیده اند. همچنین کاربران می توانند اطلاعات ژنی مورد نظر خود را وارد مرورگر سایت کرده و اهدافی مانند آموزشی و یا تحقیقاتی را دنبال کنند. مرورگر ژنوم سایت UCSC اطلاعات جانبی را در زیر موقعیتش در ژنوم ارائه می دهد که اینکار موجب درک سریع تر تفاوت اطلاعات مختلف می شود. کاربر می تواند کل یک کروموزوم را یک جا بررسی کرده تا متوجه تراکم ژنی در کروموزوم شود. همچنین بر روی کروموزوم یک باند مشخص شده را که نشان دهنده یک سیتوژنتیک خاص می باشد باز کند و موقیعت آن را در نقشه ژنی مشاهده کند. کاربر همچنین می تواند روی بخشی از ژن زوم کرده و EST پردازش شده و احتمال پردازش Alternative را مشاهده کند Genome Browser .نتیجه گیری به کاربر نمی دهد ادر عوض تمام اطلاعات مربوط به ژن را یکجا ارائه کرده و امکان تفسیر و شناسایی را برای کاربر آسان تر می کند. سایت UCSC Genome Browser از اطلاعات توالی ژنومی که به شکل متنی است پشتیبانی کرده و به جست و جوی آن در کل اطلاعات ژنومی می پردازد. همچنین نتایج را سریعا با دقت بسیار بالا ارائه می دهد. با کلیک بر روی هر آیتم این سایت اطلاعات کامل آن را نشان می دهد که شامل یک خلاصه از ویژگی های آن آیتم و همچنین سایت هایی که منبع آن می باشد. سایت هایی مثل OmimEntrez GenBank ،: pubMed

لینک های مفید

معاونت فرهنگی و اجتماعی دانشگاه الزهرا(س)