سامانه جامع معاونت فرهنگی اجتماعی | وبینار طراحی پرایمر با استفاده از نرم افزار OLIGO7

انجمن علمی دانشجویی بيوتكنولوژي

وبینار طراحی پرایمر با استفاده از نرم افزار OLIGO7

رضوانه يوسفي

نوع درخواست:	کارگاه و کلاس آموزشی (کارگاه (ورکشاپ) علمی و آموزشی )
سطح برگزاری:	دانشگاهی
مدرس:	زینب سیاحی
تاریخ برگزاری:	جمعه, 01 اسفند 1399
مکان برگزاری:	آنلاین
مجموعه‌های همکار:	زیست فن
مدت زمان برنامه(دقیقه):	180
تعداد افراد شرکت کننده:	32

انجمن علمی دانشجویی بیوتکنولوژی دانشگاه الزهرا (س) با همکاری زیست فن، "وبینار طراحی پرایمر با استفاده از نرم افزار OLIGO7" را با موضوع طراحی پرایمر با هدف آشنایی با نرم افزار OLIGO7 و طراحی پرایمر با تدریس زینب سیاحی فارغ‌التحصیل فیزیولوژی پزشکی از دانشگاه تربیت مدرس در روز جمعه 1 اسفند ماه 1399 ساعت 15 الی 18 باحضور 32 نفر از علاقمندان به صورت آنلاین برگزار کرد. سرفصل های رویداد به شرح زیر می باشد: طراحی پرایمر و ویژگی های یک پرایمر مناسب برای pcr، چگونگی انتخاب توالی مورد نظر از سایت NCBI، کار با نرم افزار OLIGO 7 پرایمر، یک مولکول کوچک تک رشته‌ای از جنس DNA است که در واکنش PCR شرکت می‌کند و سر 3پریم هیدروکسیل آزاد را در اختیار «آنزیم Taq پلیمراز» قرار می‌دهد. در ژنوم موجودات پیچیده‌ای مانند انسان، در هر ناحیه، تنها یکی از دو رشته DNA به عنوان ژن فعال، عمل می‌کند. معمولا هدف از انجام PCR، تکثیر این ناحیه است و به آن «ناحیه هدف» (Target Region) می‌گوییم. برای این کار به دو پرایمر نیاز است که یکی به رشته هدف و دیگری به رشته مکمل آن متصل می‌شود. پرایمرها یا آغازگرها، توالی های کوتاهی از جنس DNA هستند که معمولاً از ۱۸ تا ۲۴ باز تشکیل شده اند و به عنوان نقطه‌ آغاز تکثیر DNA توسط آنزیم DNA پلیمراز در طی فرآیند PCR عمل می‌کنند. آنزیم های DNA پلیمراز تنها قادر هستند نوکلئوتیدها را به انتهای ۳پریم یک رشته DNA در حال ساخت اضافه کنند، پرایمرها از اجزای ضروری فرآیند تکثیر DNA محسوب می شوند. بنابراین طراحی پرایمرهای مناسب برای درست انجام شدن یک واکنش PCR و تکثیر قطعه مورد نظر با کارایی بالا بسیار ضروری است. برای طراحی پرایمر ابتدا باید توالی ژن مورد مطالعه را با فرمت FASTA از بانک های توالی اسید نوکلئیک بدست آورد که یکی از معروف ترین آن ها سایت NCBI می باشد. در مرحله بعد، جهت طراحی پرایمر از نرم افزارهای مختلفی نظیر Oligo، gene runner، primer3، beacon designer می توان استفاده کرد.

لینک های مفید

معاونت فرهنگی و اجتماعی دانشگاه الزهرا(س)